Dalam melaksanakan, Puslitbang Kesehatan mempunyai fungsi :

• Penyusunan program dan rencana anggaran.
• Pelaksanakan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat di bidang kesehatan yang meliputi gizi dan penyakit tropis, manajemen dan resiko kesehatan dan keselamatan, tanaman obat.
• Pengembangan kerjasama penelitian dan pengabdian kepada masyarakat di bidang kesehatan.
• Pelaksanaan evaluasi kegiatan penelitian dan pengabdian masyarakat di bidang kesehatan.
• Pelaksanaan tugas lain yang diberikan oleh Ketua Lembaga Penelitian dan Pengabdian Kepada Masyarakat.